La Commissione di Garanzia è un organo collegiale di controllo  costituito da rappresentanti del Gestore dei Servizi Elettrici (GSE), di associazioni ambientaliste (WWF, Legambiente) e di tutela dei consumatori (Adiconsum, Cittadinanzattiva).

Ha durata triennale ed è presieduta da un presidente nominato dal Titolare.

I compiti della Commissione di Garanzia del Marchio sono :

• valutare l'idoneità dei soggetti che fanno domanda di adesione al Marchio dal punto di vista dei criteri generali ed etici;
• esprimere un parere consultivo sulle iniziative individuate da REEF Onlus da finanziare con i proventi di diritto d'uso del Marchio;
• stabilire con un documento apposito i criteri generali per l'accoglimento delle domande di uso del Marchio;
• definire ed aggiornare i criteri di sostenibilità delle fonti di energia ammesse.

La Commissione delibera attraverso il voto di maggioranza.